前沿交叉研究院为建制性二级机构，承担学科交叉机制自主创新“特区”建设的改革重任，兼容管理服务机构和教学科研单位的部分功能，既是推进交叉研究的策划者，又是执行交叉研究和交叉人才培养的实践者，也是协同跨学科研究机构、学科建设单位深化交叉的管理者。
前沿交叉学科研究院坚持“四个面向”，围绕学校“双一流”建设整体目标，瞄准国家关键领域急需和原始创新需求，立足学校综合优势，发挥优势学科群的聚集、辐射和平台作用，通过“自上而下”主动凝练和“自下而上”调研征集相结合的攻关问题形成机制，聚焦重点交叉领域强化前瞻性布局引领，围绕复合型人才培养根本任务和关键核心技术攻关重大功能，创新组织架构，最大限度牵引、整合学科交叉力量和资源，突破传统学科、学院和行业组织的界限，串联学科、人才、技术、政策、问题需求，贯通人才链、学科链、创新链、产业链的组织新模式，突破学科壁垒协同发展，为一流学科建设赋能。
致力于培育建设若干服务国家急需的跨学科协同攻关平台、复合型高水平人才培养体系为重点任务，立足解决重大科学问题和重大现实问题，以需求为引领，推动跨学科、多学科的交叉融合、协同作战，以学科交叉点上的突破带动相关学科面上的发展。力争成为学科交叉融合创新与新兴学科发展的孵化器，形成具有华师特色、华师优势的高水平学科交叉管理体系。